2000年5月11日，青原区经国务院批准设立。辖原县级吉安市的河东经济技术开发区（副处级）、河东镇、天玉镇和从吉安县划入的东固镇、东固垦殖管理区、富田乡、云楼乡、新圩镇、文陂乡、值夏镇，以及从吉水县划入的富滩镇 。
2001年1月18日，吉安市青原区挂牌成立，并在吉安市金竹大道（后改为文天祥大道）举行成立青原区揭牌授印仪式。2001年12月，河东镇改置为河东街道。
2002年1月，云楼乡、富田乡合并改置为富田镇。2002年6月，东固镇改置为东固畲族乡。2010年8月，河东街道析置为河东、滨江两个街道。2011年12月，文陂乡改置为文陂镇。